MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 7715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015564	GTG	2	6	1283977	1283982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_015564	CG	3	6	1283989	1283994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2003	NC_015564	CGA	2	6	1284069	1284074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_015564	TCC	2	6	1284086	1284091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_015564	CGC	2	6	1284120	1284125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_015564	GCG	2	6	1284154	1284159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_015564	AGG	2	6	1284252	1284257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_015564	GGC	2	6	1284381	1284386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_015564	CAC	2	6	1285251	1285256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2010	NC_015564	CCA	2	6	1286459	1286464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_015564	TGG	2	6	1286472	1286477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_015564	G	6	6	1286476	1286481	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_015564	GAA	2	6	1289638	1289643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_015564	CGCGC	2	10	1290731	1290740	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2015	NC_015564	GGT	2	6	1290742	1290747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_015564	TGC	2	6	1290763	1290768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_015564	GGC	2	6	1290804	1290809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_015564	GGC	2	6	1290837	1290842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_015564	CCG	2	6	1290938	1290943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2020	NC_015564	GCAC	2	8	1290952	1290959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2021	NC_015564	CAG	2	6	1290998	1291003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_015564	GGCT	2	8	1291016	1291023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2023	NC_015564	CCCG	2	8	1291032	1291039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2024	NC_015564	GCT	2	6	1291092	1291097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_015564	GATG	2	8	1291149	1291156	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_015564	CTC	2	6	1291164	1291169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2027	NC_015564	TC	3	6	1291168	1291173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2028	NC_015564	CCG	2	6	1293396	1293401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2029	NC_015564	TGA	2	6	1296499	1296504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_015564	CTC	2	6	1296507	1296512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2031	NC_015564	ACT	2	6	1296521	1296526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_015564	CCG	2	6	1296597	1296602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2033	NC_015564	ACC	2	6	1299752	1299757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2034	NC_015564	TCA	2	6	1303552	1303557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_015564	TAA	2	6	1303582	1303587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_015564	TCACA	2	10	1303622	1303631	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2037	NC_015564	ACT	2	6	1308514	1308519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_015564	GCA	2	6	1309435	1309440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_015564	CTC	2	6	1311327	1311332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2040	NC_015564	GTT	2	6	1311345	1311350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_015564	GTG	2	6	1311367	1311372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_015564	GAC	2	6	1311379	1311384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_015564	AGC	2	6	1311459	1311464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_015564	GCT	2	6	1311496	1311501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_015564	CG	4	8	1311533	1311540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2046	NC_015564	GCA	2	6	1311663	1311668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_015564	CA	3	6	1313661	1313666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2048	NC_015564	CG	3	6	1313692	1313697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2049	NC_015564	TCC	3	9	1317889	1317897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2050	NC_015564	GCCG	2	8	1319245	1319252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2051	NC_015564	CAC	2	6	1319253	1319258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2052	NC_015564	ACGC	2	8	1319294	1319301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2053	NC_015564	AGG	2	6	1319323	1319328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_015564	GCACG	2	10	1319401	1319410	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2055	NC_015564	ATG	2	6	1319414	1319419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_015564	GGT	2	6	1319860	1319865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_015564	CT	3	6	1319914	1319919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2058	NC_015564	ATC	2	6	1319994	1319999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_015564	CCT	2	6	1322976	1322981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2060	NC_015564	GC	3	6	1323047	1323052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2061	NC_015564	CGC	3	9	1323050	1323058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2062	NC_015564	GTA	2	6	1323080	1323085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_015564	CGAG	2	8	1324221	1324228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2064	NC_015564	CAG	2	6	1324660	1324665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_015564	AGG	2	6	1326578	1326583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_015564	TGC	2	6	1326634	1326639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_015564	CGG	2	6	1330199	1330204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_015564	GCG	2	6	1330227	1330232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_015564	CTG	2	6	1330233	1330238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_015564	GCG	2	6	1330241	1330246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2071	NC_015564	CCG	2	6	1330282	1330287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2072	NC_015564	GTC	2	6	1330290	1330295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2073	NC_015564	GTG	2	6	1330304	1330309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_015564	GGC	2	6	1331164	1331169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2075	NC_015564	AG	3	6	1331717	1331722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_015564	GTG	2	6	1333086	1333091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_015564	AGCA	2	8	1335045	1335052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2078	NC_015564	AAG	2	6	1335060	1335065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_015564	GA	3	6	1335067	1335072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_015564	TG	3	6	1335092	1335097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_015564	GCA	2	6	1335136	1335141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2083	NC_015564	TGG	2	6	1335266	1335271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2084	NC_015564	TCGG	2	8	1335613	1335620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2085	NC_015564	GAA	2	6	1335630	1335635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2086	NC_015564	GTTG	2	8	1336375	1336382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2087	NC_015564	GACG	2	8	1340114	1340121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2088	NC_015564	GAG	2	6	1342053	1342058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_015564	GT	3	6	1342093	1342098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_015564	GC	3	6	1342997	1343002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2091	NC_015564	GAG	2	6	1345902	1345907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_015564	CAGG	2	8	1346712	1346719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2093	NC_015564	CG	3	6	1347236	1347241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2094	NC_015564	CCCA	2	8	1347250	1347257	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2095	NC_015564	GCC	2	6	1350641	1350646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2096	NC_015564	CGA	2	6	1350694	1350699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_015564	TCG	2	6	1350750	1350755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2098	NC_015564	GC	3	6	1350835	1350840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2099	NC_015564	GGT	2	6	1350851	1350856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_015564	CGA	2	6	1350919	1350924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2101	NC_015564	TGC	2	6	1353800	1353805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_015564	TCT	2	6	1353807	1353812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_015564	CCCGTC	2	12	1355287	1355298	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2104	NC_015564	GCCC	2	8	1355410	1355417	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2105	NC_015564	CGA	3	9	1355418	1355426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_015564	CGC	2	6	1355491	1355496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2107	NC_015564	TCC	2	6	1355520	1355525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2108	NC_015564	G	7	7	1356671	1356677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_015564	CAT	2	6	1356678	1356683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2110	NC_015564	GC	3	6	1356686	1356691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2111	NC_015564	GCTC	2	8	1356697	1356704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2112	NC_015564	GTC	2	6	1356707	1356712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_015564	CG	3	6	1356767	1356772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2114	NC_015564	TCGG	2	8	1356782	1356789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2115	NC_015564	GCA	2	6	1356808	1356813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_015564	TCGA	2	8	1356820	1356827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2117	NC_015564	TGCT	2	8	1356855	1356862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2118	NC_015564	CTC	2	6	1358823	1358828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2119	NC_015564	CGGA	2	8	1358910	1358917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2120	NC_015564	GTTG	2	8	1359015	1359022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_015564	CG	3	6	1362127	1362132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2122	NC_015564	TGC	2	6	1362145	1362150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_015564	CGA	3	9	1362174	1362182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_015564	CTCA	2	8	1362187	1362194	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2125	NC_015564	AGG	2	6	1362993	1362998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_015564	TG	3	6	1363520	1363525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_015564	GGC	2	6	1363601	1363606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_015564	CAC	2	6	1363607	1363612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2129	NC_015564	GGGA	2	8	1363622	1363629	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_015564	CA	3	6	1364235	1364240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2131	NC_015564	CAC	2	6	1364398	1364403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2132	NC_015564	TGG	2	6	1364430	1364435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_015564	GTG	2	6	1364452	1364457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_015564	TC	3	6	1364490	1364495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2135	NC_015564	AGG	2	6	1364506	1364511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2138	NC_015564	GCC	2	6	1365108	1365113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2139	NC_015564	CAGC	2	8	1366863	1366870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2141	NC_015564	ACG	2	6	1368789	1368794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2147	NC_015564	CGG	2	6	1379652	1379657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2152	NC_015564	TGA	2	6	1381151	1381156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2154	NC_015564	ACG	2	6	1384646	1384651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2165	NC_015564	TGG	2	6	1403049	1403054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2245	NC_015564	TAG	2	6	1468591	1468596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2251	NC_015564	AC	3	6	1470688	1470693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2252	NC_015564	GCTGC	2	10	1474576	1474585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2253	NC_015564	TC	3	6	1474840	1474845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2254	NC_015564	TG	3	6	1474864	1474869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2257	NC_015564	TGA	2	6	1478387	1478392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2259	NC_015564	GCG	2	6	1480888	1480893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2260	NC_015564	CAA	2	6	1484816	1484821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2261	NC_015564	CGTTT	2	10	1484830	1484839	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2262	NC_015564	GTA	2	6	1484846	1484851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2295	NC_015564	GC	3	6	1511564	1511569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2377	NC_015564	TTTGG	2	10	1580685	1580694	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2379	NC_015564	TTTG	2	8	1580737	1580744	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2383	NC_015564	T	9	9	1580833	1580841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2384	NC_015564	GT	3	6	1580898	1580903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2385	NC_015564	GGC	2	6	1580948	1580953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2387	NC_015564	TTG	2	6	1581155	1581160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2388	NC_015564	GCA	2	6	1581257	1581262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2392	NC_015564	CAG	2	6	1581405	1581410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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